丽江市地貌复杂多样。山区、平坝、河谷等多种地貌类型并存,境内海拔高差达4581米,玉龙山主峰扇子陡海拔为5596米,华坪县腊乌渡金沙江边海拔为1015米。金沙江沿线河谷区,热量充足,土地资源丰富,从华坪县、永胜县沿江南部地区到玉龙县的石鼓、巨甸等沿江西部地区均属金沙江河谷区,是丽江市水稻、甘煎、烤烟、热带水果、冬早蔬菜等主要产地。沿金沙江河谷而上,在群山环抱之中,或在湖泊周围,分布有大大小小的断陷盆地,俗称"坝子"。

    境内有面积在1平方公里以上坝子一百余个,其中最大是丽江坝子,有198.63平方公里,较大的还有丽江拉市坝、永胜期纳坝、三川坝、城关坝、华坪荣将坝、宁蒗永宁坝、红旗坝等,这些坝子海拔一般在1500～2600米之间,气候温和、土壤肥沃、水源丰富,是主要产粮区、城镇所在地和主要工业商业区。山区、半山区占了丽江市百分之九十以上面积,有丰富的森林、草山、草坡资源,发展生态林业和畜牧业前景十分广阔。丽江具有典型的"立体气候"特征。

    多样的地貌,明显的海拔高差,形成了境内气候区域差异和一个地方的垂直气候,使全区兼有亚热、温、寒带三种气候。就地貌类型看,江边河谷属亚热带气候,半山区及坝区属暖温带高原山地气候,山区为寒温带高山气候;就全区范围看,西北温寒,东南暖热;就某一地看,则三种气候并存,比如玉龙山,山下金沙江边龙蟠、大具一带,海拔1500~1700米,是亚热带气候,随海拔上升,依次为暖温带、温带、寒带气候,山顶则终年积雪,为雪山冰漠带,呈现出"十里不同天,一山分四季”的气候特点。另外,由于丽江处于低纬度高原,冬夏两季日射角度变化小,地面温度比较均匀;夏秋季又受含水份较多的东南季风和西南季风的影响,阴雨天多,地面气温不易升高;加之纵横交错的高山挡住了北方寒流,所以全区大部分地区属低温带高原山区气候,冬无严寒,夏无酷暑,长年气温在12.6℃～19.9℃之间,最热月份的平均气温18.1℃～～25.7℃,最冷月份的平均气温为4.2℃～12.1℃,可谓长春无夏,春秋相连,气候宜人。丽江地区气候还具有干湿季分明的特点,由于南向云贵高原,北依青藏高原,冬夏控制本区的气团性质截然不同,形成冬干夏雨、干湿季分明的季风气候。年降水量为910～1040毫米,5～10月为雨季,而降雨多集中在每年的7、8月份。11月至次年4月为干季,雨雪量少,天晴日暖,日照时数长,光能充足。